Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM10Q9NQV6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms