Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYLDQ9NQC7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms