Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms