Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPJQ9HC77 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms