Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRDE2Q9H7Z3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms