Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC4Q9H6D8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms