Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms