Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD1Q9GZZ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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