Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL4Q9C0H6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL4Q9C0H6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms