Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP4Q9C0A0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms