Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms