Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTNAP3Q9BZ76 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTNAP3Q9BZ76 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTNAP3Q9BZ76 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTNAP3Q9BZ76 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNTNAP3Q9BZ76 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms