Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC4A5Q9BY07 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms