Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP3Q9BWW4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms