Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HIGD2AQ9BW72 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms