Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP8Q9BV40 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms