Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTA3Q9BTC8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTA3Q9BTC8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms