Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC39A3Q9BRY0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms