Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms