Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC50A1Q9BRV3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms