Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLF1Q9BQI6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms