Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGRRF1Q99675 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms