Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRNP1Q96S65 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms