Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGS1Q96RS0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGS1Q96RS0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms