Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHF12Q96QT6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms