Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3Q96PU9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ODF3Q96PU9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms