Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms