Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms