Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCZQ96LD1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms