Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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