Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms