Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VCPIP1Q96JH7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms