Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EAF1Q96JC9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms