Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms