Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED8Q96G25 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms