Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP36Q96EU6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms