Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHFRQ96EP1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHFRQ96EP1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHFRQ96EP1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CHFRQ96EP1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHFRQ96EP1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHFRQ96EP1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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