Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPRY1Q96DX4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms