Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM4SF18Q96CE8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms