Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF34Q969K3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF34Q969K3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF34Q969K3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF34Q969K3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF34Q969K3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF34Q969K3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms