Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSR2Q969E8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR2Q969E8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms