Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRF1Q92994 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms