Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P3H4Q92791 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P3H4Q92791 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P3H4Q92791 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P3H4Q92791 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P3H4Q92791 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P3H4Q92791 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H4Q92791 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H4Q92791 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H4Q92791 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H4Q92791 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H4Q92791 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms