Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX38Q92620 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX38Q92620 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms