Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG1Q92597 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG1Q92597 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms