Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms