Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERVK_113Q902F9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms