Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY2Q8WXA3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUFY2Q8WXA3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms