Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRIM41Q8WV44 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM41Q8WV44 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms