Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2AF1L4Q8WU68 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2AF1L4Q8WU68 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2AF1L4Q8WU68 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms